〔2〕明初，垛集令行，民出一丁为军，卫所无缺伍，且有羡丁。未几，大都督府言，起吴元年十月，至洪武三年1370十一月，军士逃亡者四万七千九百余。于是下追捕之令，立法惩戒。小旗逃所隶三人，降为军。上至总旗、百户、千户，皆视逃军多寡，夺俸降革。其从征在外者，罚尤严。十六年1383，命五军府檄外卫所，速逮缺伍士卒，给事中潘庸等分行清理之。明年，从兵部尚书俞纶言，京卫军户绝者，毋冒取同姓及同姓之亲，令有司核实发补，府卫毋特遣人。二十一年1388，诏卫所核实军伍，有匿己子以养子代者，不许。其秋，令卫所著军士姓名、乡贯为籍，具载丁口以便取补。又置军籍勘合，分给内外，军士遇点阅以为验。
明朝初年，实行垛集令，每户出一丁为兵，卫所没有缺额，还有多余的人。不久，大都督府报告，从吴元年十月到洪武三年十一月，士兵逃亡的有四万七千九百多人。于是下令追捕，制定法律惩戒。小旗逃跑，他管辖的三个人降为士兵。上至总旗、百户、千户，都根据逃亡士兵的数量扣发俸禄、降级或革职。那些随军出征在外的人，处罚更严。洪武十六年，命令五军府发文给外卫所，迅速逮捕缺额的士兵，给事中潘庸等人分头下去清理。第二年，采纳兵部尚书俞纶的建议，京城卫所军户绝后的，不准冒取同姓或同姓的亲属，命令有关部门核实后补充，府卫不得擅自派人。二十一年，诏令卫所核实军队编制，有隐藏自己儿子而用养子代替的，不允许。那年秋天，命令卫所登记士兵姓名、籍贯造册，详细记载人口以便补充。又设置军籍勘合，分发给内外，士兵遇到检阅时作为凭证。
〔3〕成祖即位，遣给事等官分阅天下军，重定垛集军更代法。初，三丁已上，垛正军一，别有贴户，正军死，贴户丁补。至是，令正军、贴户更代，贴户单丁者免；当军家蠲其一丁徭。
明成祖即位后，派遣给事中等官员分别检阅天下军队，重新制定垛集军的更替办法。起初，三丁以上，垛集一名正军，另外有贴户，正军死亡，贴户的丁补充。到这时，命令正军和贴户轮流更替，贴户是单丁的免除；当军的人家免除一丁的徭役。
〔4〕洪熙元年，兴州左屯卫军范济极言勾军之扰。富峪卫百户钱兴奏言：“祖本涿鹿卫军，死，父继，以功授百户。臣已袭父职，而本卫犹以臣祖为逃军，屡行勾取。”帝谓尚书张本曰：“军伍不清，弊多类此。”已而宣宗立，军弊益滋，黠者往往匿其籍，或诬攘良民充伍。帝谕兵部曰：“朝廷于军民，如舟车任载，不可偏重。有司宜审实毋混。”乃分遣吏部侍郎黄宗载等清理天下军卫。三年敕给事、御史清军，定十一条例，榜示天下。明年复增为二十二条。五年，从尚书张本请，令天下官吏、军旗公勘自洪、永来勾军之无踪者，豁免之。六年，令勾军有亲老疾独子者，编之近地，余丁赴工逋亡者例发口外，改为罚工一年，示优恤焉。八年，免苏州卫抑配军百五十九人，已食粮止令终其身者，千二百三十九人。先是，苏、常军户绝者，株累族党，动以千计，知府况钟言于朝，又常州民诉受抑为军者七百有奇，故特敕巡抚侍郎周忱清理。
洪熙元年，兴州左屯卫军士范济极力陈述勾军（追捕逃军）的骚扰。富峪卫百户钱兴上奏说：“我的祖父原是涿鹿卫的军士，死后，父亲继任，因功授百户。我已承袭父亲职位，但本卫还把我祖父当作逃军，多次行文抓捕。”皇帝对尚书张本说：“军队编制不清，弊端大多类似这样。”不久宣宗即位，军队的弊端更加严重，狡猾的人往往隐藏自己的军籍，或者诬陷、抢夺良民补充军队。皇帝告谕兵部说：“朝廷对于军和民，如同船和车装载货物，不可偏重。有关部门应审察核实，不要混淆。”于是分派吏部侍郎黄宗载等人清理天下军卫。宣德三年，敕令给事中、御史清理军队，制定十一条条例，张榜公布天下。第二年又增加为二十二条。五年，采纳尚书张本的请求，命令天下官吏、军旗共同勘验从洪武、永乐以来勾军而找不到踪迹的，予以豁免。六年，命令勾军中有父母年老有病、是独子的，编入附近的地方，其余丁壮赴工逃亡的，按规定发配口外，改为罚工一年，以示优恤。八年，免除苏州卫强迫配军一百五十九人，已吃粮但只令其终身的，一千二百三十九人。在此之前，苏州、常州军户绝后的，株连宗族，动不动数以千计，知府况钟向朝廷报告，又有常州百姓申诉被强迫为军的七百多人，所以特敕令巡抚侍郎周忱清理。
〔5〕正统初，令勾军家丁尽者，除籍；逃军死亡及事故者，或家本军籍，而偶同姓名，里胥挟雠妄报冒解，或已解而赴部声冤者，皆与豁免。定例，补伍皆发极边，而南北人互易。大学士杨士奇谓风土异宜，濒于夭折，请从所宜发戍。署兵部侍郎邝埜以为紊祖制，寝之。成化二年1466，山西巡抚李侃复请补近卫，始议行。十一年1475，命御史十一人分道清军，以十分为率，及三分者最，不及者殿。时以罪谪者逃故，亦勾其家丁。御史江昂谓非“罚弗及嗣”之义，乃禁之。
正统初年，命令勾军家丁已尽的，除去军籍；逃军死亡及发生事故的，或者家中本是军籍，而偶然同姓名，里胥挟私仇妄报冒名解送，或者已经解送而到兵部申冤的，都予以豁免。定例，补充军伍都发配极边地区，而且南北人互换。大学士杨士奇认为风土不适应，濒于死亡，请求从其所宜发配戍守。署兵部侍郎邝埜认为扰乱祖制，搁置了。成化二年，山西巡抚李侃再次请求补充近卫，才开始讨论实行。十一年，命令御史十一人分道清理军队，以十分为率，达到三分的为最优，不及的为最差。当时因罪贬谪的逃死，也勾取其家丁。御史江昂认为不符合“罚不及其子孙”的道理，于是禁止了。
〔6〕嘉靖初，捕亡令愈苛，有株累数十家，勾摄经数十年者，丁口已尽，犹移覆纷纭不已。兵部尚书胡世宁请“屡经清报者免勾。又避役之人必缓急难倚，急改编原籍。卫所有缺伍，则另选舍余及犯罪者充补。犯重发边卫者，责卖家产，阖房迁发，使绝顾念。庶卫卒皆土著，而逃亡益鲜”。帝是其言。其后，用主事王学益议，制勾单，立法详善。久之，停差清军御史，宽管解逃军及军赴卫违限之科。清军官日玩愒，文卷磨灭，议者复请申饬。
嘉靖初年，捕亡令更加苛刻，有株连数十家，勾捕经历数十年，人口已尽，仍然移文纷繁不已。兵部尚书胡世宁请求：“多次经过清理上报的，免于勾捕。又逃避徭役的人，危急时难以依靠，迅速改编回原籍。卫所有缺额，则另选舍余（军户余丁）及犯罪者充补。犯重罪发配边卫的，责令变卖家产，全家迁发，使其断绝顾念。这样卫所士卒都是土著，逃亡就会更少。”皇帝认为他说得对。其后，采用主事王学益的建议，制作勾单，立法详细完善。过了很久，停止差遣清军御史，放宽管解逃军及军士赴卫违限的处罚。清军官日益玩忽职守，文卷磨灭，议论者又请求申饬整肃。
〔7〕万历三年1575，给事中徐贞明言：“勾军东南，资装出于户丁，解送出于里递，每军不下百金。大困东南之民，究无补于军政。宜视班匠例，免其解补，而重征班银，以资召募，使东南永无勾补之扰，而西北之行伍亦充。”郧阳巡抚王世贞因言有四便：应勾之户，乐于就近，不图避匿，便一；各安水土，不至困绝，便二；近则不逃，逃亦易追，便三；解户不至破家，便四。而兵部卒格贞明议，不行。后十三年，南京兵部尚书郭应聘复请各就近地，南北改编。又言“应勾之军，南直隶至六万六千余，株连至二三十万人，请自天顺以前竟与释免”。报可，远近皆悦。然改编令下，求改者相继。明年，兵部言“什伍渐耗，边镇军人且希图脱伍”。有旨复旧，而应聘之议复不行。
万历三年，给事中徐贞明说：“在东南勾军，资装费用出自户丁，解送出自里递，每个军士不下百金。大大困扰东南百姓，最终对军政无补。应该参照班匠的例子，免除其解送补充，而重征班银，用来资助招募，使东南永远没有勾补的骚扰，而西北的行伍也能充实。”郧阳巡抚王世贞因此说有四便：应勾的户，乐于就近，不图逃避，是一便；各安水土，不至困绝，是二便；近则不逃，逃也易追，是三便；解户不至破家，是四便。但兵部最终阻止了徐贞明的建议，没有实行。后来十三年，南京兵部尚书郭应聘再次请求各就近地，南北改编。又说“应勾的军士，南直隶达六万六千余人，株连到二三十万人，请从天顺以前全部予以释免”。批复同意，远近都高兴。然而改编令下，请求改迁的人相继。第二年，兵部说“什伍逐渐耗减，边镇军人还希图脱伍”。有旨恢复旧制，而郭应聘的建议又不行了。
〔8〕凡军卫掌于职方，而勾清则武库主之。有所勾摄，自卫所开报，先核乡贯居止，内府给批，下有司提本军，谓之跟捕；提家丁，谓之勾捕。间有恩恤开伍者。洪武二十三年1390，令应补军役生员，遣归卒业。宣德四年1429，上虞人李志道充楚雄卫军，死，有孙宗皋宜继。时已中乡试，尚书张本言于帝，得免。如此者绝少。户有军籍，必仕至兵部尚书始得除。军士应起解者，皆佥妻；有津给军装、解军行粮、军丁口粮之费。其册单编造皆有恒式。初定户口、收军、勾清三册。嘉靖三十一年1552，又编四册，曰军贯，曰兜底，曰类卫、类姓。其勾军另给军单。盖终明世，于军籍最严。然弊政渐丛，而扰民日甚。
凡是军卫由职方司掌管，而勾清则由武库司主管。有所勾摄，从卫所开报，先核实乡贯居止，内府给批文，下到有关部门提本军，叫做跟捕；提家丁，叫做勾捕。间或有恩恤开伍的。洪武二十三年，命令应补军役的生员，遣回完成学业。宣德四年，上虞人李志道充楚雄卫军，死后，有孙子李宗皋应当继承。当时已中乡试，尚书张本向皇帝进言，得以免除。像这样的事极少。户有军籍，必须做到兵部尚书才能除籍。军士应起解的，都佥派妻子；有津给军装、解军行粮、军丁口粮的费用。其册单编造都有固定格式。起初定户口、收军、勾清三册。嘉靖三十一年，又编四册，叫军贯、兜底、类卫、类姓。其勾军另外给军单。大致整个明朝，对军籍最严。然而弊政渐渐丛生，扰民日益严重。