〔9〕圣师之祭，始于世宗。奉皇师伏羲氏、神农氏、轩辕氏、帝师陶唐氏，有虞氏，王师夏禹王、商汤王、周文王武王，九圣南向。左先圣周公，右先师孔子，东西向。每岁春秋开讲前一日，皇帝服皮弁，拜跪，行释奠礼。用羹酒果脯帛祭于文华殿东室。
圣师的祭祀，是从世宗皇帝开始的。供奉皇师伏羲氏、神农氏、轩辕氏，帝师陶唐氏、有虞氏，王师夏禹王、商汤王、周文王、周武王，这九圣面向南方。左边是先圣周公，右边是先师孔子，东西相向。每年春秋两季开讲的前一天，皇帝穿着皮弁服，行跪拜之礼，举行释奠礼。用肉羹、酒、果品、肉干、丝帛等祭品，在文华殿东室祭祀。
〔10〕初，东室有释像，帝以其不经，撤之，乃祀先圣先师。自为祭文，行奉安神位礼。辅臣礼卿及讲官俟行礼讫，入拜。先是洪武初，司业宋濂建议欲如建安熊氏之说，以伏羲为道统之宗，神农、黄帝、尧、舜、禹、汤、文、武，以次列焉。秩祀天子之学，则道统益尊。太祖不从。至是，世宗仿其意行之。十六年1521，移祀于永明殿后，行礼如初。其后常遣官代祭。隆庆初，仍于文华殿东室行礼。
最初，文华殿东室有佛像，皇帝认为它不合经典，就撤掉了，改而祭祀先圣先师。皇帝亲自撰写祭文，行奉安神位的礼仪。辅政大臣、礼部尚书和讲经官员等侯行礼结束后，进来跪拜。在此之前，洪武初年，国子监司业宋濂建议想按照建安熊氏的说法，把伏羲作为道统的始祖，神农、黄帝、尧、舜、禹、汤、文王、武王依次排列。在天子学宫中按等级祭祀，这样道统会更加尊崇。太祖没有听从。到这时，世宗效仿这个意思实行了。嘉靖十六年，把祭祀移到永明殿后面，行礼和原先一样。此后经常派官员代行祭祀。隆庆初年，仍然在文华殿东室行礼。
〔11〕汉晋及隋或称先师，或称先圣、宣尼、宣父。唐谥文宣王，宋加至圣号，元复加号大成。明太祖入江淮府，首谒孔子庙。洪武元年1368二月，诏以太牢祀孔子于国学，仍遣使诣曲阜致祭。临行谕曰：“仲尼之道，广大悠久，与天地并。有天下者莫不虔修祀事。朕为天下主，期大明教化，以行先圣之道。今既释奠成均，仍遣尔修祀事于阙里，尔其敬之。”又定制，每岁仲春、秋上丁，皇帝降香，遣官祀于国学。以丞相初献，翰林学士亚献，国子祭酒终献。先期，皇帝斋戒。献官、陪祀、执事官皆散斋二日，致斋一日。前祀一日，皇帝服皮弁服，御奉天殿降香。至日，献官行礼。三年1370，诏革诸神封号，惟孔子封爵仍旧。且命曲阜庙庭，岁官给牲币，俾衍圣公供祀事。四年1371，礼部奏定仪物。改初制笾豆之八为十，笾用竹。其簠簋登铏及豆初用木者，悉易以瓷。牲易以熟。乐生六十人，舞生四十八人，引舞二人，凡一百一十人。礼部请选京民之秀者充乐舞生，太祖曰：“乐舞乃学者事，况释奠所以崇师，宜择国子生及公卿子弟在学者，豫教肄之。”五年1372，罢孟子配享。逾年，帝曰：“孟子辨异端，辟邪说，发明孔子之道，配享如故。”七年1374二月，上丁日食，改用仲丁。
从汉朝、晋朝到隋朝，孔子有时候被称作‘先师’，有时候被称作‘先圣’、‘宣尼’、‘宣父’。唐朝时追封他为文宣王，宋朝加了‘至圣’的称号，元朝又加了‘大成’的称号。明太祖攻入江淮府，首先就去拜谒了孔子庙。洪武元年二月，下诏用太牢（牛、羊、猪三牲）在国子监祭祀孔子，还派了使者到曲阜去祭祀。临行前他告谕说：‘仲尼的道理，广大又长久，跟天地并立。凡拥有天下的人，没有谁不是虔诚地举行祭礼的。我作为天下的君主，希望大力昌明教化，来推行先圣的道理。如今已经在国子监举行了释奠礼，还派你到阙里修祭，你可要恭敬啊。’后来又定下制度，每年二月和八月上旬的丁日，皇帝要降香，派官员到国子监祭祀。由丞相担任初献，翰林学士担任亚献，国子祭酒担任终献。在此之前，皇帝要斋戒。献官、陪祀和办事官员都要散斋两天，致斋一天。祭祀的前一天，皇帝穿着皮弁服，到奉天殿降香。到了祭祀那天，献官行礼。洪武三年，下诏革除各位神灵的封号，只有孔子的封爵保持原样。并且命令曲阜的孔庙，每年由官府供给牲和币，让衍圣公负责祭祀的事务。洪武四年，礼部奏请确定祭祀用的器物。把最初规定的八件笾豆改成十件，笾用竹制。那些原来用木头做的簠、簋、登、铏和豆，全都换成瓷器。牲品改成煮熟的。乐生六十人，舞生四十八人，引舞两人，一共一百一十人。礼部请求挑选京城百姓中优秀的人充当乐舞生，太祖说：‘乐舞是学者的事，况且释奠是为了尊崇老师，应该从国子生和公卿子弟中正在学习的里面挑选，预先教他们练习。’洪武五年，取消了孟子的配享。过了一年，皇帝说：‘孟子辨别异端，驳斥邪说，发扬了孔子的道理，配享照旧。’洪武七年二月，上丁日出现了日食，改用仲丁日。
〔12〕十五年1382，新建太学成。庙在学东，中大成殿，左右两庑，前大成门，门左右列戟二十四。门外东为牺牲厨，西为祭器库，又前为灵星门。自经始以来，驾数临视。至是落成，遣官致祭。帝既亲诣释奠，又诏天下通祀孔子，并颁释奠仪注。凡府州县学，笾豆以八，器物牲牢，皆杀于国学。三献礼同，十哲两庑一献。其祭，各以正官行之，有布政司则以布政司官，分献则以本学儒职及老成儒士充之。每岁春、秋仲月上丁日行事。初，国学主祭遣祭酒，后遣翰林院官，然祭酒初到官，必遣一祭。十七年1384，敕每月朔望，祭酒以下行释菜礼，郡县长以下诣学行香。二十六年1393，颁大成乐于天下。二十八年1395，以行人司副杨砥言，罢汉扬雄从祀，益以董仲舒。三十年1397，以国学孔子庙隘，命工部改作，其制皆帝所规画。大成殿门各六楹，灵星门三，东西庑七十六楹，神厨库皆八楹，宰牲所六楹。永乐初，建庙于太学之东。
洪武十五年，新建的太学落成了。孔庙在太学的东边，中央是大成殿，左右两侧是东西两庑，前面是大成门，大成门左右各陈列着十二支戟（共二十四支）。门外东边是牺牲厨，西边是祭器库，再往前是灵星门。自从开始兴建以来，皇帝多次亲临视察。到这时完工，派遣官员举行了祭祀。皇帝已经亲自到太学举行了释奠礼，又下诏命令天下普遍祭祀孔子，并颁布了释奠的礼仪规范。所有府、州、县的学校，祭祀用的笾和豆等器皿各用八个，其他器物和牺牲祭品，都比国学的规格降低。三献礼的礼仪相同，但十哲和两庑只进行一次献礼。祭祀时，各自由正职官员主持，有布政司的地方由布政司官员主持，分献则由本学校的儒学教职和年高有德的儒生担任。每年春季和秋季的第二个月的上丁日进行祭祀活动。起初，国学的祭祀派遣祭酒主持，后来派遣翰林院官员，但祭酒刚到任时，必定派遣他主持一次祭祀。洪武十七年，下诏命令每月初一和十五，祭酒以下官员举行释菜礼，各郡县长官以下到学校行香。二十六年，向天下颁布大成乐。二十八年，根据行人司副杨砥的建议，取消汉朝扬雄的从祀资格，增加董仲舒。三十年，因为国学的孔子庙狭窄，命令工部改建，其规制都是皇帝亲自规划的。大成殿和大成门各六间，灵星门三间，东西两庑共七十六间，神厨和祭器库各八间，宰牲所六间。永乐初年，在太学的东边建造了庙宇。
〔13〕宣德三年1428，以万县训导李译言，命礼部考正从祀先贤名位，颁示天下。十年1435，慈利教谕蒋明请祀元儒吴澄。大学士杨士奇等言当从祀，从之。正统二年1437，以宋儒胡安国、蔡沈、真德秀从祀。三年1438，禁天下祀孔子于释、老宫。孔、颜、孟三氏子孙教授裴侃言：“天下文庙惟论传道，以列位次。阙里家庙，宜正父子，以叙彝伦。颜子、曾子、子思，子也，配享殿廷。无繇、子昽、伯鱼，父也，从祀廊庑。非惟名分不正，抑恐神不自安。况叔梁纥元已追封启圣王，创殿于大成殿西崇祀，而颜、孟之父俱封公，惟伯鱼、子昽仍侯，乞追封公爵，偕颜、孟父俱配启圣王殿。”帝命礼部行之，仍议加伯鱼、子昽封号。成化二年1466，追封董仲舒广川伯，胡安国建宁伯，蔡沈崇安伯，真德秀浦城伯。十二年1476，从祭酒周洪谟言，增乐舞为八佾，笾豆各十二。弘治八年1495，追封杨时将乐伯。从祀，位司马光之次。九年1496，增乐舞为七十二人，如天子之制。十二年1499，阙里孔庙毁，敕有司重建。十七年1504，庙成，遣大学士李东阳祭告，并立御制碑文。正德十六年1521，诏有司改建孔氏家庙之在衢州者，官给钱，董其役。令博士孔承义奉祀。
宣德三年，因为万县训导李译的建议，皇帝命令礼部考证和修正从祀先贤的名位，并向全国公布。宣德十年，慈利教谕蒋明请求祭祀元代儒者吴澄。大学士杨士奇等人认为应该从祀，皇帝同意了。正统二年，将宋代儒者胡安国、蔡沈、真德秀列入从祀。正统三年，禁止天下在佛寺和道观中祭祀孔子。孔、颜、孟三氏子孙教授裴侃上书说："全国的文庙只考虑传道的次序来排列位次。阙里的孔氏家庙，应该端正父子关系，以遵循人伦秩序。颜子、曾子、子思是儿子，却在殿廷配享；他们的父亲无繇、子昽、伯鱼反而在廊庑从祀。这不仅名分不正，恐怕神灵内心也不安。况且叔梁纥在元代已经被追封为启圣王，在大成殿西边创建了殿宇隆重祭祀，而颜回、孟子的父亲都封了公，只有伯鱼、子昽仍然是侯爵，请求追封他们为公爵，和颜回、孟子的父亲一起在启圣王殿配享。"皇帝命令礼部办理，并商议加封伯鱼、子昽的封号。成化二年，追封董仲舒为广川伯，胡安国为建宁伯，蔡沈为崇安伯，真德秀为浦城伯。成化十二年，采纳祭酒周洪谟的建议，将乐舞增加到八佾，笾豆各十二个。弘治八年，追封杨时为将乐伯，从祀位置排在司马光之后。弘治九年，将乐舞增加到七十二人，如同天子的规格。弘治十二年，阙里孔庙被烧毁，命令有关部门重建。弘治十七年，孔庙建成，派遣大学士李东阳前往祭告，并树立了皇帝撰写的碑文。正德十六年，下诏有关部门改建位于衢州的孔氏家庙，官府拨给经费，监督管理工程。命令博士孔承义主持祭祀。
〔14〕嘉靖九年1530，大学士张璁言：“先师祀典，有当更正者。叔梁纥乃孔子之父，颜路、曾昽、孔鲤乃颜、曾、子思之父，三子配享庙庭，纥及诸父从祀两庑，原圣贤之心岂安？请于大成殿后，别立室祀叔梁纥，而以颜路、曾昽、孔鲤配之。”帝以为然。因言：“圣人尊天与尊亲同。今笾豆十二，牲用犊，全用祀天仪，亦非正礼。其谥号、章服悉宜改正。”璁缘帝意，言：“孔子宜称先圣先师，不称王。祀宇宜称庙，不称殿。祀宜用木主，其塑像宜毁。笾豆用十，乐用六佾。配位公侯伯之号宜削，止称先贤先儒。其从祀申党、公伯寮、秦冉等十二人宜罢，林放、蘧瑗等六人宜各祀于其乡，后苍、王通、欧阳修、胡瑗、蔡元定宜从祀。”
嘉靖九年，大学士张璁上奏说：“祭祀先师孔子的典礼，有应当修正的地方。叔梁纥是孔子的父亲，颜路、曾昽、孔鲤分别是颜回、曾参、子思的父亲，现在颜回、曾参、子思三人配享在庙庭，而叔梁纥、颜路、曾昽、孔鲤这些父亲们却只能从祀在两边的廊庑，从圣贤的本心来看怎么能安心呢？请求在大成殿的后面，另外建一间房屋专门祭祀叔梁纥，并以颜路、曾昽、孔鲤配享。”皇帝认为他说得对。于是又说：“圣人尊崇上天和尊崇父母是同样的道理。如今祭祀孔子用十二个笾豆，牺牲用小牛，完全采用祭祀上天的礼仪，这也不是正当的礼制。孔子的谥号、礼服都应该改正。”张璁顺着皇帝的意思，说：“孔子应该称为‘先圣先师’，而不称‘王’。祭祀的场所应该叫‘庙’，不叫‘殿’。祭祀应该用木制神主，那些塑像应该毁掉。笾豆用十个，乐舞用六佾。配享者的公、侯、伯等爵号应当削去，只称‘先贤’、‘先儒’。那些从祀的申党、公伯寮、秦冉等十二人应当罢免，林放、蘧瑗等六人应当各自在他们的家乡祭祀，后苍、王通、欧阳修、胡瑗、蔡元定应当列入从祀。”