〔21〕有功尝上疏论天官、秋官及朝堂三司理匦使愆失，其略曰：“陛下即位已来，海内职员一定，而天下选人渐多。掌选之曹用舍不平，补拟乖次，嘱请公行，颜面罔惧。遂使嚣谤满路，怨讟盈朝，浸以为常，殊无愧惮。又往属唐朝季年，时多逆节，鞫讯结断，刑狱至严。革命以来，载祀遽积，余风未殄，用法犹深。今推鞫者犹行酷法，妄劾断。臣即按验，奏而劾之，获其枉状，请即付法断罪，亦夺禄贬考，以惭其德。其三司受表及理匦申冤使，不速与夺，致令拥塞，有理不为申者，亦望准前弹奏，贬考夺禄。臣昔处法司，缘蒙擢用，臣无以上答至造，愿以执法酬恩。无纵诡随，不避强御，猛噬鸷击，是臣之分。如蒙允纳，请降敕施行，庶不越旬时，亦可以除残革弊，刑措不用，天下幸甚。”
徐有功曾上疏论述天官（吏部）、秋官（刑部）以及朝堂三司和理匦使的过失，大意说：“陛下即位以来，天下官员的员额已经固定，但参选的人越来越多。掌管选官的部门任用罢免不公平，补拟职务违背次序，请托公然进行，对人情面子毫不顾忌。于是导致喧嚣诽谤满路，怨恨充斥朝廷，渐渐习以为常，毫无惭愧畏惧之心。又以前在唐朝末年，叛逆事件很多，审讯判决，刑法非常严酷。改朝换代以来，岁月已经积累，但余风未除，用法仍然严苛。现在审案的人仍然施行酷法，胡乱弹劾判决。我立即查验，上奏弹劾他们，查到冤枉的证据，请求交付法司定罪，同时剥夺俸禄、降低考核等级，以使其羞愧。至于三司受理奏表以及理匦申冤使，不迅速做出裁决，导致案件积压，有理不能申冤的，也希望按照前例弹劾，降低考核、剥夺俸禄。我过去在司法部门任职，承蒙提拔任用，我无以报答圣上，愿意以执法来报答恩情。不放纵狡诈之人，不避强权，像猛兽一样攻击邪恶，这是我的本分。如果蒙陛下允许采纳，请下敕令施行，大概不超过十天半月，就可以除去残暴、革除弊端，使刑罚搁置不用，天下幸运得很。”
〔22〕后润州刺史窦孝谌妻庞氏为奴诬告，云夜解祈福，则天令给事中薛季昶鞫之。季昶锻练成其罪，庞氏当坐斩。有功独明其无罪。而季昶等返陷有功党援恶逆，奏付法，法司结刑当弃市。有功方视事，令史垂泣以告，有功曰：“岂吾独死，而诸人长不死耶？”乃徐起而归。则天览奏，召有功诘之曰：“卿比断狱，失出何多？”对曰：“失出，臣下之小过；好生，圣人之大德。愿陛下弘大德，则天下幸甚。”则天默然。于是庞氏减死，流于岭表，有功除名为庶人。寻起为左司郎中，累迁司刑少卿。有功谓所亲曰：“今身为大理，人命所悬，必不能顺旨诡辞以求苟免。”故前后为狱官，以谏奏枉诛者，三经断死，而执志不渝，酷吏由是少衰，时人比汉之于、张焉。或曰：“若狱官皆然，刑措何远。”久之，转司仆少卿子。长安二年702卒，年六十二，赠司刑卿。
后来，润州刺史窦孝谌的妻子庞氏被家奴诬告，说她在夜里解开头发祈祷求福，武则天命令给事中薛季昶审理此案。薛季昶罗织罪名，定下庞氏的罪，庞氏应当被判处斩刑。只有徐有功坚持认为她没有罪。但薛季昶等人反而诬陷徐有功结党营私、包庇恶逆之人，上奏要求交付法司审理，法司判决徐有功应当处以弃市（公开处死）的刑罚。徐有功正在办公，令史哭着告诉他这个消息，徐有功说：“难道只有我一个人会死，而其他人就能永远不死吗？”于是慢慢起身回家。武则天看到奏章后，召见徐有功质问他说：“你近来审理案件，为什么判轻了（放纵罪犯）的案子那么多？”徐有功回答说：“判轻了，是臣下的小过失；珍惜生命，是圣人的大德。希望陛下弘扬大德，那么天下就非常幸运了。”武则天沉默不语。于是庞氏被免除死罪，流放到岭南，徐有功被削去官职，贬为平民。不久，徐有功又被起用为左司郎中，多次升迁至司刑少卿。徐有功对亲近的人说：“现在我身为大理寺官员，关系到人的性命，一定不能顺从皇帝旨意、说假话来苟且免祸。”所以他前后担任司法官员，因为上谏奏请纠正冤案，曾三次被判死刑，但始终坚守志向不改变，酷吏因此有所收敛，当时的人把他比作汉代的于定国和张释之。有人说：“如果司法官员都像他这样，刑法搁置不用（天下太平）的日子还会远吗？”过了很久，徐有功转任司仆少卿。长安二年去世，享年六十二岁，追赠司刑卿。
〔23〕中宗即位，制曰：“忠正之臣，自昔攸尚；褒赠之典，旧章所重。故赠大理卿徐有功，节操贞劲，器怀亮直，徇古人之志业，实一代之贤良，司彼刑书，深存敬慎。周兴、来俊臣等性惟残酷，务在诛夷，不顺其情，立加诬害。有功卓然守法，虽死不移，无屈挠之心，有忠烈之议。当其执断，并遇平反，定国、释之，何以加此。朕惟新庶政，追想前迹，其人既殁，其德可称。追往赠终，慰兹泉壤。可赠越州刺史，仍遣使就家吊祭，赐物百段，授一子官。”今上践祚，窦孝谌之子希瑊等请以身之官爵让有功子惀，以报旧恩。惀由是自太子司议郎、恭陵令累迁申王府司马，卒。
唐中宗即位后，下诏说：“忠诚正直的臣子，自古以来就被推崇；褒奖追赠的典礼，是旧章中的重事。已故的大理卿徐有功，节操坚贞刚劲，胸怀明亮正直，遵循古人的志业，确实是一代贤良。他掌管刑法，深怀敬慎之心。周兴、来俊臣等人本性残酷，一心要诛杀他人，不顾实情，立即加以诬陷。徐有功卓然守法，即使面临死亡也不改变，没有屈挠之心，有忠烈之节。他主持判决时，都能平反冤案，即使张释之、于定国这样的贤臣，也不能超过他。朕如今革新政务，追想前人的事迹，此人虽已去世，其德行值得称颂。追赠官职，恩及身后，以慰泉下。可追赠越州刺史，并派使者到家中吊唁祭祀，赐物百段，授其一子官职。”当今皇上（唐玄宗）即位后，窦孝谌的儿子窦希瑊等人请求把自己的官爵让给徐有功的儿子徐惀，以报答旧恩。徐惀于是从太子司议郎、恭陵令逐步升迁至申王府司马，后去世。
〔24〕史臣曰：文法，理具之大者，故舜命皋陶为士，昌言诫敕，勤亦至焉。盖人命所悬，一失其平，冤不可复，圣王所以疚心也。如临之守法，文瓘之议刑，时属哲王，可以理夺。当贼后迁鼎之际，酷吏罗织之辰，徐有功独抗群邪，持平不挠，此所以为难也。比释之、定国，徐又过之。希瑊让爵酬恩，可知遗爱。
史官评论说：法律条文，是治理国家的重要工具，所以舜任命皋陶为司法官，直言告诫，非常勤勉。因为人命关天，一旦执法不公，冤案就无法挽回，这是圣明君王所忧心的事。像唐临的守法，张文瓘的议刑，当时遇上贤明的君主，可以用道理来说服。当武则天篡位之时，酷吏罗织罪名之际，徐有功独自对抗群邪，持平不挠，这才是最难能可贵的。与张释之、于定国相比，徐有功还超过了他们。窦希瑊让爵报恩，可见徐有功遗留的仁爱。