〔1〕枢密院，秩从一品，掌天下兵甲机密之务。凡宫禁宿卫，边庭军翼，征讨戍守，简阅差遣，举功转官，节制调度，无不由之。世祖中统四年，置枢密副使二员，佥书枢密事一员。至元七年1270，置同知枢密院事一员，院判一员。二十八年1291，始置知院一员，增院判一员，又以中书平章商量院事。大德十年1306，增置知院二员，同知五员，副枢五员，佥院五员，同佥三员，院判二员。至大三年1310，知院七员，同知二员，副枢二员，佥院一员，同佥一员，院判二员，革去议事平章。延祐四年，以分镇北边，增知院一员。五年，增同知一员。后定置知院六员，从一品；同知四员，正二品；副枢二员，从二品；佥院二员，正三品；同佥二员，正四品；院判二员，正五品；参议二员，正五品；经历二员，从五品；都事四员，正七品；承发兼照磨二员，正八品；架阁库管勾一员，正九品；同管勾一员，从九品；掾史二十四人，译史一十四人，通事三人，司印二人，宣使一十九人，铨写二人，蒙古书写二人，典吏一十七人，院医二人。
枢密院，官阶是从一品，掌管全国军事机密的事务。凡是宫廷警卫、边境驻防、征讨戍守、检阅军队、调兵遣将、论功行赏、调动官职、指挥调度等，全都由它负责。元世祖中统四年，设置了两位枢密副使，一位佥书枢密事。至元七年，设置了一位同知枢密院事和一位院判。至元二十八年，开始设置一位知院，增加一位院判，又让中书省的平章政事参与商议枢密院事务。大德十年，增设了两位知院、五位同知、五位副枢、五位佥院、三位同佥、两位院判。至大三年，知院有七位，同知两位，副枢两位，佥院一位，同佥一位，院判两位，并撤销了议事平章的职位。延祐四年，因为要分兵镇守北方边境，增设一位知院。延祐五年，增设一位同知。后来固定设置：知院六名（从一品）、同知四名（正二品）、副枢两名（从二品）、佥院两名（正三品）、同佥两名（正四品）、院判两名（正五品）、参议两名（正五品）、经历两名（从五品）、都事四名（正七品）、承发兼照磨两名（正八品）、架阁库管勾一名（正九品）、同管勾一名（从九品）、掾史二十四名、译史十四名、通事三名、司印两名、宣使十九名、铨写两名、蒙古书写两名、典吏十七名、院医两名。
〔2〕客省使，秩从五品。大使二员，副使二员。至元十四年1277，置大使一员。十六年1279，增一员。二十一年1284，置副使一员。延祐五年1318，增一员。天历元年1328，又增一员。寻定置大使二员，从五品；副使二员，从六品；令史二人。
客省使这个官职，品级是从五品。设有大使两人，副使两人。元至元十四年，设置了一位大使。到至元十六年，又增加了一位大使。至元二十一年，设置了一位副使。延祐五年，增加了一位副使。天历元年，又增加了一位副使。不久后确定设置大使两人，从五品；副使两人，从六品；另外还有令史两人。
〔3〕断事官，秩正三品，掌处决军府之狱讼。至元元年，始置断事官二员。八年，增二员。十九年，又增一员。二十年，又增二员。大德十一年，又增四员。皇庆元年，省二员。后定置断事官八员，正三品；经历一员，从七品；令史六人，译史一人，通事、知印、奏差、典吏各一人。
断事官这个官职，级别是正三品，负责处理军队衙门里的诉讼案件。到了至元元年，开始设立了两名断事官。至元八年，又增加了两名。至元十九年，又增加了一名。至元二十年，又增加了两名。大德十一年，又增加了四名。皇庆元年，裁减了两名。后来固定设置八名断事官，级别为正三品；下设经历一名，级别是从七品；还有令史六人，译史一人，以及通事、知印、奏差、典吏各一人。
〔4〕行枢密院。国初有征伐之事，则置行枢密院。大征伐，则止曰行院。为一方一事而设，则称某处行枢密院，或与行省代设，事已则罢。
行枢密院。元朝初年，有出征讨伐的事情时，就会设立行枢密院。如果是大规模的征伐，就只简称为行院。为了一方或一件具体事务而设置的，就称为某某地方的行枢密院。有时也会与行省互相替代设置，事情结束后就撤销。
〔5〕西川行枢密院，中统四年1263始置，设官二员，管四川军民课税交钞、打捕鹰房人匠，及各投下应管公事，节制官吏诸色人等，并军官迁授征进等事。始置于成都。至元十年1273，又于重庆别置东川行枢密院，设官一员。十三年1276，并为一院，寻复分东川行院。十六年1279，罢两川行院。二十八年1291，复立四川行院于成都。
西川行枢密院是在中统四年开始设立的，设置了两个官员，管理四川军队和百姓的税收、纸币、捕猎鹰隼的工匠，以及各个王公封地内需要处理的公事，管辖各级官吏和各种人员，还负责军官的职务调动和出征等事务。最初设在成都。到了至元十年，又在重庆另外设置了东川行枢密院，设一个官员。至元十三年，合并成一个院，不久又分设了东川行院。至元十六年，撤销了两个川行院。至元二十八年，再次在成都设立四川行院。
〔6〕江南行枢密院。至元十年1273，罢河南省统军司、汉军都元帅、山东行院，置荆湖等路行院，设官三员；淮西行院，设官二员。掌调度军马之事。十二年1275，罢行院。十九年1282，诏于杨州、岳州俱立行院，各设官五员。二十一年1284，立沿江行院。二十二年1285，立江西行院，马军戍江州，步军戍抚州。二十八年1291，徙岳州行院于鄂州，徙江淮行院于建康，其后行院悉并归行省。
江南行枢密院。至元十年（1273年），撤销了河南省统军司、汉军都元帅、山东行院，设置了荆湖等路行院，设官员三人；淮西行院，设官员二人。掌管调度军队的事务。至元十二年，撤销了行院。至元十九年，下诏在扬州、岳州都设立行院，各设官员五人。至元二十一年，设立沿江行院。至元二十二年，设立江西行院，骑兵驻守江州，步兵驻守抚州。至元二十八年，把岳州行院迁移到鄂州，把江淮行院迁移到建康，此后行院全部合并归入行省。
〔7〕甘肃行枢密院。至大四年1311，置行院于甘州，为甘肃等处行枢密院，设官四员，提调西路军马。后以甘肃省丞相提调，遂罢行院。
甘肃行枢密院。至大四年，在甘州设立行枢密院，称为“甘肃等处行枢密院”，设置了四名官员，负责管理西路的军队。后来让甘肃省的丞相来管理，于是撤掉了这个行枢密院。
〔8〕河南行枢密院，致和元年1328分置，专管调遣之事。天历元年1328罢。
河南行枢密院是在致和元年（1328年）分设的，专门负责调兵遣将的事情。到了天历元年（1328年）就被撤销了。
〔9〕岭北行枢密院，天历二年1329置。知院一员，同知二员，副枢一员，佥院二员，同佥一员，院判二员，经历一员，都事二员，蒙古必阇赤四人，掾史二人，怯里马赤一人，知印一人，宣使四人。掌边庭军务，凡大小事宜，悉从裁决。
岭北行枢密院，在天历二年设立。设有知院一员、同知二员、副枢一员、佥院二员、同佥一员、院判二员、经历一员、都事二员、蒙古必阇赤四人、掾史二人、怯里马赤一人、知印一人、宣使四人。负责处理边疆的军务，所有大小事务，都由这里裁决处理。
〔10〕右卫，秩正三品。中统三年1262，初置武卫。至元元年1264，改为侍卫。八年1271，改为左、右、中三卫，掌宿卫扈从，兼屯田。国有大事，则调度之。二十年1283，增都指挥使一员、副都指挥使一员。二十一年1284，置佥事二员。大德十一年1307，增都指挥使二员、副都指挥使一员。至大元年1308，增都指挥使三员、副都指挥使一员。四年1311，省都指挥使五员、副都指挥使二员。后定置都指挥使三员，正三品；副都指挥使二员，从三品；佥事二员，正四品；经历二员，从七品；知事二员，照磨一员，俱从八品；令史七人，译史、通事、知印各一人。又其属十有五：
右卫这个机构，官阶是正三品。中统三年的时候，最初设置了武卫。到了至元元年，改成了侍卫（亲军）。至元八年，又分为左卫、右卫、中卫三个卫，负责皇宫的警卫和随行护驾，同时兼管军队屯田。如果国家有大事发生，就由朝廷直接调遣他们。至元二十年，增加了一名都指挥使和一名副都指挥使。至元二十一年，设置了两名佥事。大德十一年，增加两名都指挥使和一名副都指挥使。至大元年，增加三名都指挥使和一名副都指挥使。至大四年，裁减了五名都指挥使和两名副都指挥使。后来固定下来，设置了三个都指挥使，正三品；两个副都指挥使，从三品；两个佥事，正四品；两个经历，从七品；两个知事、一个照磨，都是从八品；还有七个令史，以及译史、通事、知印各一人。另外，它的下属单位有十五个。
〔12〕行军千户所十，秩正五品。达鲁花赤十员，副达鲁花赤十员，千户十员，副千户十员，弹压二十员，百户二百员，知事十员。
设有十个行军千户所，官阶为正五品。配备达鲁花赤十名，副达鲁花赤十名，千户十名，副千户十名，弹压二十名，百户二百名，知事十名。
〔13〕弩军千户所一，秩正五品。达鲁花赤一员，千户一员，弹压二员，百户十员。
有一个弩军千户所，级别是正五品。编制是这样：一位达鲁花赤，一位千户，两位弹压，十位百户。
〔14〕屯田左右千户所二，秩正五品。达鲁花赤二员，千户二员，弹压二员，百户四十员。
设置了两个屯田左右千户所，官阶为正五品。每个千户所设置达鲁花赤两人、千户两人、弹压两人、百户四十人。
〔15〕教官二，蒙古字教授一员，儒学教授一员。掌诸屯卫行伍耕战之暇，使之习学国字，通晓书记。初由枢府选举，后归吏部。
设立了两个教官职位，一个是蒙古字教授，一个是儒学教授。他们的职责是，在那些屯田驻军的队伍耕作和打仗的空闲时间里，让他们学习蒙古文字，通晓文书事务。起初这些教官由枢密院选拔任命，后来改归吏部管理。
〔16〕左卫，秩正三品。至元八年1271，以侍卫改置。掌宿卫扈从，兼屯田。国有大事，则调度之。是年，增副指挥使一员。十六年1279，增副都指挥使一员。二十年1283，置佥事一员。二十二年1285，增佥事一员。二十四年1287，省都指挥使、副都指挥使一员。大德十一年1307，增都指挥使五员、副都指挥使二员、佥事二员。至大四年1311，省都指挥使六员、副都指挥使二员。其后定制，卫官：都指挥使二员，正三品；副都指挥使二员，从三品；佥事二员，正四品；经历二员，从七品；知事二员，照磨一员，俱从八品；令史七人，译史、通事、知印各一人。其属十有五：
左卫，官阶为正三品。至元八年（1271年），由侍卫改置而成。负责宫廷警卫和皇帝出行的随从，同时兼管屯田事务。国家有重大事情时，就调动它。同年，增设副指挥使一人。十六年（1279年），增设副都指挥使一人。二十年（1283年），设置佥事一人。二十二年（1285年），增设佥事一人。二十四年（1287年），裁减都指挥使、副都指挥使各一人。大德十一年（1307年），增设都指挥使五人、副都指挥使两人、佥事两人。至大四年（1311年），裁减都指挥使六人、副都指挥使两人。此后确定制度，卫的官员：都指挥使两人，正三品；副都指挥使两人，从三品；佥事两人，正四品；经历两人，从七品；知事两人，照磨一人，都是从八品；令史七人，译史、通事、知印各一人。其下属有十五个机构。
〔18〕行军千户所凡十，秩正五品。达鲁花赤十员，副达鲁花赤十员，千户十员，副千户十员，弹压二十员，百户二百员，知事十员。
行军千户所一共设了十个，官阶是正五品。这些千户所总共配置了十名达鲁花赤、十名副达鲁花赤、十名千户、十名副千户、二十名弹压、二百名百户和十名知事。
〔19〕弩军千户所一，秩正五品。达鲁花赤一员，千户一员，弹压二员，百户十员。
有一个弩军千户所，级别是正五品。编制是这样：一位达鲁花赤，一位千户，两位弹压，十位百户。
〔20〕屯田左右千户所二，秩正五品。达鲁花赤一员，千户二员，弹压二员，百户四十员。
有左右两个屯田千户所，官阶为正五品。每个所设有达鲁花赤一人，千户二人，弹压二人，百户四十人。