〔5〕初，崇德元年1636，设蒙古衙门，置承政、参政各官。三年1638，更名理藩院，定承政，左、右参政，各一人，副理事官八人，启心郎一人。顺治元年1644，改承政为尚书，参政为侍郎，（满、蒙参用。）副理事官为员外郎，置二十有一人，（康熙二十年1681增满、蒙八人。乾隆四十二年1777省蒙古一人，四十九年1784改满洲二人为蒙缺。后满、蒙司官增减不一。）启心郎三人，（满洲一人，汉军二人。十五年1750省。）堂主事二人，（康熙二十八年1689增汉文一人。）司务二人，（满、蒙各一人。康熙三十八年1699省。雍正十年1732复故。）汉副使一人。（从八品。）五年1727，增置汉院判、（正六品。）知事（正八品。自副使以下，俱康熙三十八年1699省。）各一人。四年1665，置唐古忒学教习一人。（给六品俸。后改司业。其助教以他官兼。乾隆五年1740定为额缺，寻省。）十六年1751，定以礼部尚书衔掌院事，侍郎衔协理院事。越二年，以隶礼部未合旧制，停兼衔，依六部例，令入议政，班居工部后。并设录勋、宾客、柔远、理刑四司，置满、蒙郎中共十有一人，（乾隆四十二年1777增蒙古一人。四十九年1784改满洲二人为蒙缺。）员外郎二十有一人，（康熙二十年1681增满、蒙八人。乾隆四十二年1777省蒙古一人。四十九年1784改满洲六人为蒙缺。）主事满、汉各四人。（康熙二十八年1689省汉缺。乾隆四十九年1784改满洲二人为蒙缺。）康熙二十年1681，增蒙古文主事二人。三十八年1699，析柔远司为二，曰前司，曰后司。四十六年1707，设银库，（初制，蒙古王、台吉等入朝，由户、工二部及光禄寺庀器用，具廪饩。至是始创设。）置郎中、员外郎各一人，（司员内奏派。）司库一人，库使四人。雍正元年1723，始命王、公、大学士领院事，省库使二人。乾隆二十二年1757，改录勋司为典属，宾客司为王会，柔远后司为旗籍，前司仍曰柔远。二十六年1761，合旗籍、柔远为一，增设徕远一司。明年，仍析旗籍、柔远为二。二十九年1764，改典属司为旗籍，旧旗籍为典属。嘉庆四年1799，改满洲郎中、员外郎各一人为宗室员缺。咸丰五年1855，定伊犁塔尔巴哈台通商章程，始司外交职务。（见第十七款。）十年1860，定中俄续约，以军机处及本院典外交文移。（见第九款。后归外部。）光绪三十二年1906，更院为部，拟设殖产、边卫二司。嗣先设编纂、调查二局，隶领办处，（以汉档房、俸档房、督催所改并。汉档房主事缺未省。）寻置员外郎、主事各一人。（蒙古房改。俱蒙缺。）宣统三年1911，改尚书为大臣，侍郎为副大臣，额外侍郎如故。
最初，崇德元年（1636年），设立蒙古衙门，设置承政、参政等官职。崇德三年，改名为理藩院，确定承政一人，左、右参政各一人，副理事官八人，启心郎一人。顺治元年（1644年），将承政改为尚书，参政改为侍郎（满、蒙人混用），副理事官改为员外郎，设置二十一人（康熙二十年增加满、蒙八人，乾隆四十二年减去蒙古一人，四十九年改满洲二人为蒙古缺额，后来满、蒙司官增减不一），启心郎三人（满洲一人，汉军二人，顺治十五年省去），堂主事二人（康熙二十八年增加汉文一人），司务二人（满、蒙各一人，康熙三十八年省去，雍正十年恢复），汉副使一人（从八品）。顺治五年，增设汉院判（正六品）、知事（正八品。从副使以下，都在康熙三十八年省去）各一人。顺治四年，设置唐古忒学教习一人（给六品俸禄，后改司业，其助教由其他官员兼任。乾隆五年定为额缺，不久省去）。顺治十六年，规定以礼部尚书衔掌管院事，侍郎衔协助管理院事。过了两年，认为隶属礼部不符合旧制，停止兼衔，依照六部之例，让理藩院参与议政，班次排在工部之后。并设置录勋、宾客、柔远、理刑四个司，设满、蒙郎中共十一人（乾隆四十二年增加蒙古一人，四十九年改满洲二人为蒙古缺额），员外郎二十一人（康熙二十年增加满、蒙八人，乾隆四十二年省去蒙古一人，四十九年改满洲六人为蒙古缺额），主事满、汉各四人（康熙二十八年省去汉缺，乾隆四十九年改满洲二人为蒙古缺额）。康熙二十年，增加蒙古文主事二人。康熙三十八年，将柔远司分为前司和后司。康熙四十六年，设置银库（起初，蒙古王、台吉等入朝，由户部、工部和光禄寺准备器具和粮食，到这时才创设），设郎中、员外郎各一人（从司员中奏派），司库一人，库使四人。雍正元年，开始命令王、公、大学士领导院事，省去库使二人。乾隆二十二年，将录勋司改为典属司，宾客司改为王会司，柔远后司改为旗籍司，前司仍叫柔远司。乾隆二十六年，合并旗籍、柔远为一司，增设徕远一司。第二年，又分旗籍、柔远为二司。乾隆二十九年，将典属司改为旗籍司，原来的旗籍司改为典属司。嘉庆四年，将满洲郎中、员外郎各一人改为宗室员缺。咸丰五年，制定《伊犁塔尔巴哈台通商章程》，开始管理外交事务（见第十七款）。咸丰十年，签订中俄续约，由军机处和理藩院负责外交文书（见第九款，后来归外务部）。光绪三十二年，将理藩院改为理藩部，计划设置殖产、边卫两个司。随后先设编纂、调查两个局，隶属领办处（由汉档房、俸档房、督催所改并而成，汉档房主事缺额未省），不久设置员外郎、主事各一人（由蒙古房改，均为蒙古缺额）。宣统三年，将尚书改为大臣，侍郎改为副大臣，额外侍郎不变。
〔6〕理藩一职，历古未有专官，唯《周官·大行人》差近之。秦、汉以降，略存规制。遐荒绝漠，统治王官，为有清创制。自译署设，职权渐替已。
理藩这个职务，历代都没有专门的官员，只有《周官》中的大行人一职稍微接近。秦汉以后，大致保留了一些规制。但像清朝这样，在遥远荒凉的沙漠地区，都由朝廷命官来统治，是有清一代的创举。自从总理各国事务衙门设立后，理藩院的职权逐渐被取代了。
〔7〕都察院左都御史，（初制，满员一品，汉员二品。顺治十六年1659并改二品。康熙六年1667仍升满员为一品，九年1670并定正二品。雍正八年1730升从一品。）左副都御史，（正三品。）俱满、汉二人。其属：经历司经历，（正六品。）都事厅都事，（正六品）。俱满、汉一人。笔帖式四十有二人。十五道掌印监察御史，（初制，满洲、汉军三品，顺治十六年1659改七品。康熙六年1667升四品，九年1670复为七品。雍正七年1729，改由编、检、郎员授者正五品。由主事、中、行、评、博授者正六品。乾隆十七年1752并定从五品。）满、汉各一人。监察御史，京畿、江西、浙江、福建、湖广、河南、山西、陕西八道，满、汉各一人，江南道满、汉各三人，山东道满、汉各二人。
都察院设左都御史（最初制度，满员一品，汉员二品。顺治十六年都改为二品。康熙六年又升满员为一品，九年都定为正二品。雍正八年升为从一品），左副都御史（正三品），都是满、汉各二人。下属机构：经历司经历（正六品），都事厅都事（正六品），都是满、汉各一人。笔帖式四十二人。十五道掌印监察御史（最初制度，满洲、汉军三品，顺治十六年改为七品。康熙六年升为四品，九年又恢复七品。雍正七年，改由编修、检讨、郎中、员外郎授任的为正五品，由主事、中书、行人、评事、博士授任的为正六品。乾隆十七年都定为从五品），满、汉各一人。监察御史，京畿、江西、浙江、福建、湖广、河南、山西、陕西八道，满、汉各一人；江南道满、汉各三人；山东道满、汉各二人。
〔8〕左都御史掌察覈官常，参维纲纪。率科道官矢言职，率京畿道纠失检奸，并豫参朝廷大议。凡重辟，会刑部、大理寺定谳。祭祀、朝会、经筵、临雍，执法纠不如仪者。左副都御史佐之。十五道掌弹举官邪，敷陈治道，各覈本省刑名。（京畿道分理院事，及直隶、盛京刑名，稽察内阁、顺天府、大兴、宛平两县。河南道照刷部院诸司卷宗，稽察吏部、詹事府、步军统领、五城。江南道稽察户部、宝泉局、左右翼监督、京仓、总督漕运，磨勘三库奏销。浙江道稽察礼部及本院。山西道稽察兵部、翰林院、六科、中书科、总督仓场、坐粮厅、大通桥监督、通州二仓。山东道稽察刑部、太医院、总督河道，催比五城命盗案牍缉捕之事。陕西道稽察工部、宝源局，覆勘在京工程。湖广道稽察通政使司、国子监。江西道稽察光禄寺。福建道稽察太常寺。四川道稽察銮仪卫。广东道稽察大理寺。广西道稽察太仆寺。云南道稽察理藩院、钦天监。贵州道稽察鸿胪寺。）其祭祀、监礼、侍班纠仪，科道同之。经历掌董察吏胥。都事掌缮写章奏。其分摄者：巡视五城御史，满、汉各一人，（科道中简用。一年更替。）掌绥靖地方，釐剔奸弊。兵马司指挥、（正六品。）副指挥、（正七品。）吏目，（未入流。自正指挥以下俱汉员。）五城各一人，掌巡缉盗贼，平治道路，稽检囚徒，火禁区为十坊领之。
左都御史负责考察官员的品行，维护朝廷纲纪。率领科道官尽职尽责，率领京畿道纠正过失、检举奸邪，并参与朝廷重大决策。凡是死刑重案，会同刑部、大理寺审定判决。在祭祀、朝会、经筵、临雍等场合，执法纠察不合礼仪者。左副都御史辅佐他。十五道负责弹劾官员的邪恶，陈述治国之道，各自核查本省的刑事案件。（京畿道分管本院事务，以及直隶、盛京的刑名，稽察内阁、顺天府、大兴、宛平两县。河南道负责照刷各部院各司的卷宗，稽察吏部、詹事府、步军统领、五城。江南道稽察户部、宝泉局、左右翼监督、京仓、总督漕运，磨勘三库奏销。浙江道稽察礼部及本院。山西道稽察兵部、翰林院、六科、中书科、总督仓场、坐粮厅、大通桥监督、通州二仓。山东道稽察刑部、太医院、总督河道，催比五城命盗案牍缉捕之事。陕西道稽察工部、宝源局，覆勘在京工程。湖广道稽察通政使司、国子监。江西道稽察光禄寺。福建道稽察太常寺。四川道稽察銮仪卫。广东道稽察大理寺。广西道稽察太仆寺。云南道稽察理藩院、钦天监。贵州道稽察鸿胪寺。）祭祀、监礼、侍班纠仪，科道官共同负责。经历负责督察吏员。都事负责缮写奏章。其分管的还有：巡视五城御史，满、汉各一人（从科道中选用，一年更换一次），负责安定地方，剔除奸弊。兵马司指挥（正六品）、副指挥（正七品）、吏目（未入流，从正指挥以下都是汉员），五城各一人，负责巡缉盗贼，平整道路，稽查囚徒，火禁区分为十坊管理。